Kubernetes 最佳实践:处理容器数据磁盘被写满

Kubernetes 最佳实践:处理容器数据磁盘被写满

Fri Jun 7, 2019

1300 Words|Read in about 3 Min
Tags: kubernetes  

容器数据磁盘被写满造成的危害: - 不能创建 Pod (一直 ContainerCreating) - 不能删除 Pod (一直 Terminating) - 无法 exec 到容器

判断是否被写满:

容器数据目录大多会单独挂数据盘,路径一般是 /var/lib/docker,也可能是 /data/docker/opt/docker,取决于节点被添加时的配置:

可通过 docker info 确定:

$ docker info
...
Docker Root Dir: /var/lib/docker
...

如果没有单独挂数据盘,则会使用系统盘存储。判断是否被写满:

$ df
Filesystem     1K-blocks     Used Available Use% Mounted on
...
/dev/vda1       51474044  4619112  44233548  10% /
...
/dev/vdb        20511356 20511356         0 100% /var/lib/docker

解决方法

先恢复业务,清理磁盘空间

重启 dockerd (清理容器日志输出和可写层文件)

  • 重启前需要稍微腾出一点空间,不然重启 docker 会失败,可以手动删除一些docker的log文件或可写层文件,通常删除log:
$ cd /var/lib/docker/containers
$ du -sh * # 找到比较大的目录
$ cd dda02c9a7491fa797ab730c1568ba06cba74cecd4e4a82e9d90d00fa11de743c
$ cat /dev/null > dda02c9a7491fa797ab730c1568ba06cba74cecd4e4a82e9d90d00fa11de743c-json.log.9 # 删除log文件

注意: 使用 cat /dev/null > 方式删除而不用 rm,因为用 rm 删除的文件,docker 进程可能不会释放文件,空间也就不会释放;log 的后缀数字越大表示越久远,先删除旧日志。

  • 将该 node 标记不可调度,并将其已有的 pod 驱逐到其它节点,这样重启dockerd就会让该节点的pod对应的容器删掉,容器相关的日志(标准输出)与容器内产生的数据文件(可写层)也会被清理:
kubectl drain 10.179.80.31
  • 重启 dockerd:
systemctl restart dockerd
  • 取消不可调度的标记:
kubectl uncordon 10.179.80.31

定位根因,彻底解决

问题定位方法见附录,这里列举根因对应的解决方法:

  • 日志输出量大导致磁盘写满:
    • 减少日志输出
    • 增大磁盘空间
    • 减小单机可调度的pod数量
  • 可写层量大导致磁盘写满: 优化程序逻辑,不写文件到容器内或控制写入文件的大小与数量
  • 镜像占用空间大导致磁盘写满:
    • 增大磁盘空间
    • 删除不需要的镜像

附录

查看docker的磁盘空间占用情况

$ docker system df -v

定位容器写满磁盘的原因

进入容器数据目录(假设是 /var/lib/docker,并且存储驱动是 aufs):

$ cd /var/lib/docker
$ du -sh *

  • containers 目录: 体积大说明日志输出量大
  • aufs 目录

- diff 子目录: 容器可写层,体积大说明可写层数据量大(程序在容器里写入文件) - mnt 子目录: 联合挂载点,内容为容器里看到的内容,即包含镜像本身内容以及可写层内容

找出日志输出量大的 pod

TKE 的 pod 中每个容器输出的日志最大存储 1G (日志轮转,最大10个文件,每个文件最大100m,可用 docker inpect 查看):

$ docker inspect fef835ebfc88
[
    {
         ...
        "HostConfig": {
            ...
            "LogConfig": {
                "Type": "json-file",
                "Config": {
                    "max-file": "10",
                    "max-size": "100m"
                }
            },
...

查看哪些容器日志输出量大:

$ cd /var/lib/docker/containers
$ du -sh *

目录名即为容器id,使用前几位与 docker ps 结果匹配可找出对应容器,最后就可以推算出是哪些 pod 搞的鬼

找出可写层数据量大的 pod

可写层的数据主要是容器内程序自身写入的,无法控制大小,可写层越大说明容器写入的文件越多或越大,通常是容器内程序将log写到文件里了,查看一下哪个容器的可写层数据量大:

$ cd /var/lib/docker/aufs/diff
$ du -sh *

通过可写层目录(diff的子目录)反查容器id:

$ grep 834d97500892f56b24c6e63ffd4e520fc29c6c0d809a3472055116f59fb1d2be /var/lib/docker/image/aufs/layerdb/mounts/*/mount-id
/var/lib/docker/image/aufs/layerdb/mounts/eb76fcd31dfbe5fc949b67e4ad717e002847d15334791715ff7d96bb2c8785f9/mount-id:834d97500892f56b24c6e63ffd4e520fc29c6c0d809a3472055116f59fb1d2be

mounts 后面一级的id即为容器id: eb76fcd31dfbe5fc949b67e4ad717e002847d15334791715ff7d96bb2c8785f9,使用前几位与 docker ps 结果匹配可找出对应容器,最后就可以推算出是哪些 pod 搞的鬼

找出体积大的镜像

看看哪些镜像比较占空间

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